Изучение микробиологических показателей ферментированного байкальского омуля, изготовленного с применением молочнокислых бактерий
Рубрики: ТЕХНОЛОГИЯ
Аннотация и ключевые слова
Аннотация (русский):
Работа посвящена изучению влияния процесса ферментации на состав микрофлоры ферментированного продукта из байкальского омуля (Coregonus migratorius (Georgi, 1775)), произведенного с применением бактериального концентрата молочнокислых бактерий Latilactobacillus sakei ((Katagiri et al. 1934) Zheng et al. 2020). Установлено, что по микробиологическим показателям ферментированный продукт из байкальского омуля соответствует требованиям нормативной документации. Микрофлора контрольной (без применения бактериальных препаратов) и опытной (с применением бактериального концентрата молочнокислых бактерий) партий имели существенные отличия.

Ключевые слова:
ферментация, байкальский омуль, качество, безопасность пищевых продуктов, микробиологические показатели, молочнокислые бактерии, микрофлора, 16S рРНК
Текст
Текст (PDF): Читать Скачать

 

Введение

Известно, что ферментация является одним из старейших способов консервирования, который широко применяется для производства молочных (кефир, кумыс, йогурт), зерновых (хлеб, ферментированные каши), овощных (квашеная капуста, кимчи) продуктов. Применение ферментации для производства рыбных продуктов имеет давние традиции. Так, ферментированный рыбный соус под названием гарум производился еще в Древнем Риме [14]. В странах Северной Европы традиционные рыбные продукты производятся промышленно и пользуются популярностью у местного населения [14]. В странах Азии ассортимент ферментированных рыбных продуктов очень широк и в основном представлен рыбными соусами и рыбными пастами [1].

В последние годы большой научный интерес представляет применение специально подобранных стартовых культур для производства рыбных продуктов. В этом направлении активно ведутся исследования зарубежных ученых. Полученные результаты свидетельствуют о том, что применение бактериальных культур способствует улучшению органолептических характеристик, сокращению продолжительности технологического процесса, повышает безопасность рыбных продуктов [1; 15]

Роль микробиологических показателей при формировании качества и безопасности рыбных продуктов велика. Состав микрофлоры ферментированных рыбных продуктов служил объектом исследования многих ученых, в том числе Bjerke, G.A и др., Belleggia L. и др [4; 5; 11]. При определении видового состава микрофлоры различных объектов исследования используются современные молекулярно-генетические методы, которые имеют высокую точность.

Молочнокислые бактерии активно применяются в качестве бактериальных стартовых культур для производства рыбных продуктов. Одним из перспективных видов молочнокислых бактерий, для использования в рыбоперерабатывающей промышленности, является вид Latilactobacillus sakei, адаптированный к условиям роста в рыбной и мясной средах и обладающий потенциальными пробиотическими свойствами [18].

В результате ранее проведенных нами исследований, был разработан бактериальный концентрат, обладающий высокой биохимической активностью, предназначенный для применения при ферментации рыбных продуктов. Была доказана его высокая эффективность в процессе ферментации байкальского омуля, разработаны оптимальные условия производства ферментированного рыбного продукта [2].

В связи с вышеизложенным, целью исследования является изучение влияния процесса ферментации на состав микрофлоры ферментированного омуля.

 

Объекты и методы исследований

Экспериментальные исследования проводились на кафедре «Технология молочных продуктов. Товароведение и экспертиза товаров» ФГБОУ ВО «Восточно-Сибирского государственного университета технологий и управления» (ВСГУТУ). Изучение состава микрофлоры рыбных продуктов проводилось в ФГБУН «Институт химической биологии и фундаментальной медицины Сибирского отделения Российской академии наук» (ИХБФМ СО РАН).

Объектами экспериментальных исследований служили ферментированные продукты, изготовленные из байкальского омуля (Coregonus migratorius (Georgi, 1775)). При проведении исследования изучали две партии:

а) контрольную, при изготовлении которой не применялся бактериальный концентрат молочнокислых бактерий;

б) опытную, при производстве которой применялся бактериальный концентрат молочнокислых бактерий, произведенный с применением штамма Latilactobacillus sakei LSK-104. Штамм был получен из коллекции Национального биоресурсного центра – Всероссийской коллекции промышленных микроорганизмов (НБЦ ВКПМ) ФГУП «Государственный научно-исследовательский институт генетики и селекции промышленных микроорганизмов Национального исследовательского центра «Курчатовский институт» (ГосНИИгенетика).

При производстве ферментированного рыбного продукта применяли мороженый байкальский омуль по ГОСТ 32366-2013. Посол проводился тузлучным способом с применением солевого раствора с концентрацией хлорида натрия 7%. В состав тузлука опытной партии также входила глюкоза (1%). Ферментация проводилась при следующих режимах: 24 ч при температуре 20°С, затем – 27 суток при температуре 6-8 С.

Отбор образцов проводили по окончании ферментации, согласно требованиям ГОСТ 31339-2006.

Количественный учет молочнокислых бактерий проводили с применением метода предельных разведений на плотной питательной среде MRS (De Man, Rogosa, Sharpe) при температуре 37±1°С. Подсчет колоний проводили через 48 часов.

Оценку микробиологических показателей безопасности (бактерии группы кишечных палочек ферментированного рыбного продукта (БГКП), коагулазоположительных стафилококков и Staphylococcus aureus, сульфитредуцирующих клостридий, патогенных микроорганизмов, в том числе сальмонелл, Listeria monocytogenes) проводили в соответствии с требованиями действующей нормативной документации (ГОСТ 31747-2012, ГОСТ 31746-2012, ГОСТ 29185-2014, ГОСТ 31659-2012, ГОСТ 32031-2012).

Определение состава микрофлоры проводилось с применением метода 16S рРНК, в соответствии с Brouchkov A. и др. [6]. Все реагенты, использованные для выделения ДНК и дальнейших анализов, имели класс для молекулярной биологии. Растворы и буферы не содержали ДНКазы и были стерилизованными. Все процедуры проводились в ламинарных боксах I класса.

ДНК из образцов (из 0,25 г продукта) была извлечена и проанализирована с помощью набора PowerSoil DNA Isolation Kit (MO-Bio), в соответствии с протоколом производителя. В этих экспериментах три эквивалентные подпробы из одной исходной пробы осадка были выделены путем помещения их в стерильные флаконы емкостью 50 мл. Таким образом, для данного исследования использовали три биологические повторности, которые, перед проведением исследования, смешивали до однородности.  

Регион V3-V4 гена 16S рРНК амплифицировали с применением праймеров 343F (5'-CTCCTACGGRRSGCAGCAG-3') и 806R (5'-GGACTACNVGGGTWTCTAAT-3′), содержащих адаптерные последовательности Illumina, линкер и баркод. Амплификацию проводили в соответствии с Brouchkov A. и др. [6].

Секвенирование проводили в ЦКП «Геномика» СО РАН (ИХБФМ СО РАН, Новосибирск, Россия) на секвенаторе MiSeq (Illumina) с использованием набора MiSeq Reagent Kit v2 (500 cycle) (Illumina).

Полученные парные последовательности были проанализированы с помощью UPARSE скриптов [8] при использовании USEARCH версии 8.1.1861. Биоинформатическая обработка включала в себя следующее: перекрывание парных прочтений, фильтрацию по качеству и длине, учет одинаковых последовательностей, отбрасывание синглтонов, удаление химер и получение ОТЕ (операционные таксономические единицы) с помощью алгоритма кластеризации UPARSE. Таксономическая принадлежность последовательностей OTE определялась с применением классификатора RDP classifier 2.11 [17] и базы данных NCBI 16S с использованием BLASTN [3].

 

Результаты исследований

На первом этапе исследований проводили оценку микробиологических показателей качества и безопасности ферментированных рыбных продуктов из байкальского омуля (табл. 1). При этом показатели безопасности сравнивали с нормативными значениями по ТР ЕАЭС 040/2016 «О безопасности рыбы и рыбной продукции».

 

Таблица 1. Микробиологические показатели качества и безопасности ферментированного продукта из байкальского омуля

Table 1. Microbiological indicators of quality and safety of fermented Baikal omul

Показатели качества и безопасности

Нормативное значение

Полученные результаты

контроль

опыт

Молочнокислые бактерии, КОЕ/г, не менее

-

не измерялось

2∙108

Бактерии группы кишечных

палочек (колиформы) (БГКП)

не допускаются в 0,1 г продукта

не обнаружено

S. aureus

не допускаются в 0,1 г продукта

не обнаружено

Сульфитредуцирующие клостридии

не допускаются в 0,1 г продукта

не обнаружено

Патогенные микроорганизмы

(в т.ч. сальмонеллы)

не допускаются в 25 г продукта

не обнаружено

L. monocytogenes

не допускаются в 25 г продукта

не обнаружено

 

Установлено, что ферментированный продукт из байкальского омуля содержит высокое количество жизнеспособных клеток молочнокислых бактерий (2∙108 КОЕ/г), а по показателям безопасности продукт из омуля опытной и контрольной партий соответствует требованиям ТР ЕЭАС 040/2016.

Состав микрофлоры является важной характеристикой, определяющей качество и безопасность ферментированной рыбы. В связи с этим, на втором этапе исследований проводили оценку состава микрофлоры ферментированных рыбных продуктов (рис. 1).

 

 

а)

 

б)

Рисунок 1. Состав бактериального сообщества ферментированного продукта из  байкальского омуля, по данным анализа последовательностей фрагментов генов 16S рРНК: а) на уровне бактериальных фил, б) на уровне рода

Figure 1. The composition of the bacterial community of fermented Baikal omul, according to the analysis of sequences of fragments of 16S rRNA genes: a) at the level of bacterial phyla, b) at the level of the genus

 

В результате проведенных исследований установлено, что доминирующими филумами в образцах являются Proteobacteria (81,09% – в контрольном образце, 46,71% – в опытном образце) и Firmicutes (18,62% – в контрольном образце, 53,15% – в опытном образце). На долю других филумов приходится лишь 0,29% – в контрольном образце и 0,14% – в опытном образце (рис. 1а). При дальнейшем анализе были выявлены доминирующие OTE бактерий на уровне родов (рис. 1б). Так, основными родами филы Firmicutes в опытном образце являлись Latilactobacillus и Carnobacterium. Proteobacteria в сообществе были представлены родами Psychrobacter и Halomonas. В контрольном образце к основным родам филы Firmicutes относятся Clostridiales incertae sedis XI и Carnobacterium, а филы ProteobacteriaPsychrobacter, Pseudomonas, Halomonas и Providencia.

Из представленных на рисунке 1 данных можно сделать вывод о том, что микрофлора опытной и контрольной партий ферментированного рыбного продукта имела существенные различия, к которым можно отнести следующее:

а) увеличение доли бактерий рода Latilactobacillus в опытном образце, что объясняется применением бактериального концентрата молочнокислых бактерий при ферментации;

б) снижение количества бактерий отдельных родов, в опытном образце (например, бактерий рода Psychrobacter и Pseudomonas). Такая закономерность может быть обусловлена тем, что штамм синтезирует комплекс бактериоцинов и обладает высокой антагонистической активностью. Следует отметить высокую значимость этого свойства в связи с тем, что некоторые из штаммов видов Psychrobacter и Pseudomonas могут вызывать инфекции у человека и животных;

в) относительное количество бактерий Halomonas практически одинаково в опытном и контрольных образцах, а бактерий рода Carnobacterium увеличивается в опытном образце.

Доминирующими видами бактерий в контрольной партии являются: Psychrobacter cibarius, Urmitella timonensis, Halomonas zhanjiangensis, Providencia burhodogranariea, Psychrobacter pulmonis, Carnobacterium gallinarum. Доминирующими видами бактерий опытной партии являются Latilactobacillus sakei, Psychrobacter cibarius, Carnobacterium gallinarum, Halomonas zhanjiangensis. Некоторые из доминирующих в продуктах бактериальных видов и штаммов являются характерными для рыбы и рыбных продуктов: например, штамм Psychrobacter cibarius JG-219 (идентичность 100%) является аэробной мезофильной грамотрицательной бактерией, впервые выделенной из корейского ферментированного рыбного продукта jeotgal [10]; аэробный мезофильный грамотрицательный штамм Halomonas zhanjiangensis JSM 078169 (идентичность 99,30%) – из морского ежа [7], бактерии вида Carnobacterium gallinarum обнаружены в составе микрофлоры кишечника атлантической трески (в объектах данного исследования обнаружен штамм Carnobacterium gallinarum DSM 4847 с идентичностью 99,53%) [13]. Некоторые имеют другое происхождение: например, аэробные мезофильные грамотрицательные штаммы Providencia burhodogranariea B (идентичность 99,53%) и Psychrobacter pulmonis CCUG 46240 (идентичность 100%) выделены из гемолимфы фруктовой дрозофилы и легких ягнят, соответственно, и являются патогенными для животных [9; 16]; штамм Urmitella timonensis Marseille-P2918 (идентичность 94,54%) был выделен из микробиоты недоедающих детей [12].

Микрофлора продукта из байкальского омуля, ферментированного с применением бактериального концентрата Latilactobacillus sakei, имеет существенные отличия от других ферментированных рыбных продуктов. Так, к преобладающей микрофлоре шведского продукта surströmming, изготовленного из балтийской сельди, относятся виды Halanaerobium praevalens, Alkalibacterium gilvum, Carnobacterium spp., Tetragenococcus halophilus, Clostridiisalibacter spp. и Porphyromonadaceae. К второстепенной микрофлоре можно отнести Psychrobacter celer, Ruminococcaceae, Marinilactibacillus psychrotolerans, Streptococcus infantis, Salinivibrio costicola [4].

Исследование Osimani и др. посвящено изучению состава микрофлоры хакарла, традиционного продукта Гренландии, изготовленного из мяса акулы. В работе отмечается, что основными родами бактерий являются Tissierella, Pseudomonas, Oceanobacillus, Abyssivirga и Lactococcus, а второстепенными – Alkalibacterium, Staphylococcus, Proteiniclasticum, Acinetobacter, Erysipelothrix, Anaerobacillus, Ochrobactrum, Listeria и Photobacterium [11].

Наиболее близким, разработанному продукту из байкальского омуля, по составу микрофлоры, по всей видимости, является норвежский продукт rakfisk. Так, установлено, что его микрофлора сильно зависит от технологических режимов производства: при содержании соли 4-5% и температуре 5-7°C молочнокислые микроорганизмы, преимущественно Latilactobacillus sakei, доминируют в микрофлоре этого продукта. При более высоких концентрациях соли (6%) и более низкой температуре (3-4°C) молочнокислые бактерии хотя и присутствуют в продукте, но не доминируют в составе микрофлоры. В этом случае к доминирующим относятся другие психротрофные и солеустойчивые виды бактерий, например, Psychrobacter [14]. Похожая картина наблюдалась при исследовании тузлука продукта rakfisk. В образцах одного из производителей доминирующими являются Lactobacillales, Lactobacillaceae, Leuconostoc, Carnobacterium и Pediococcus, а в образцах другого – Psychrobacter, Halomonas и Pseudoalteromonas [5].

 

Выводы

В результате проведенных исследований установлено, что по микробиологическим показателям продукты контрольной (без применения молочнокислых бактерий) и опытной (с применением бактериального концентрата молочнокислых бактерий) партий ферментированного продукта из байкальского омуля соответствуют установленным в нормативной документации нормам, а по составу микрофлоры партии существенно отличаются.

Список литературы

1. Безопасность и качество рыбо- и морепродуктов / Г. Аллан Бремнер (ред.). - СПб.: Профессия ,2009. - 512 с.

2. Никифорова А.П., Хазагаева С.Н., Хамагаева И.С. Изучение процесса ферментации байкальского омуля с применением молочнокислых бактерий // Вестник Камчатского государственного технического университета. - 2021. - № 55. - С. 17-28.

3. Altschul, S.F., Gish, W., Miller, W., Myers, E.W., Lipman, D.J. Basic local alignment search tool. J. Mol. Biol. - 1990. - 215. - Pp. 403-410.

4. Belleggia L, Aquilanti L, Ferrocino I, Milanović V, Garofalo C, Clementi F, Cocolin L, Mozzon M, Foligni R, Haouet MN, Scuota S, Framboas M, Osimani A. Discovering microbiota and volatile compounds of surströmming, the traditional Swedish sour herring. - Food Microbiol. - 2020. - 91. - 103503.

5. Bjerke, G.A.; Rudi, K.; Avershina, E.; Moen, B.; Blom, H.; Axelsson, L. Exploring the Brine Microbiota of a Traditional Norwegian Fermented Fish Product (Rakfisk) from Six Different Producers during Two Consecutive Seasonal Productions. // Foods. - 2019. - 8. - P. 72.

6. Brouchkov A, Kabilov M, Filippova S, Baturina O, Rogov V, Galchenko V, Mulyukin A, Fursova O, Pogorelko G. Bacterial community in ancient permafrost alluvium at the Mammoth Mountain (Eastern Siberia). Gene. - 2017. - 15(636). - Pp. 48-53.

7. Chen YG, Zhang YQ, Huang HY, Klenk HP, Tang SK, Huang K, Chen QH, Cui XL, Li WJ. Halomonas zhanjiangensis sp. nov., a halophilic bacterium isolated from a sea urchin. Int J Syst Evol Microbiol. - 2009. - 59(Pt 11). - Pp. 2888-93.

8. Edgar R.C. UPARSE: highly accurate OTU sequences from microbial amplicon reads // Nat. Methods. - 2013. - V. 10. - Pp. 996-998.

9. Juneja P, Lazzaro BP. Providencia sneebia sp. nov. and Providencia burhodogranariea sp. nov., isolated from wild Drosophila melanogaster. Int J Syst Evol Microbiol, 2009. - 59(Pt 5). - Pp. 1108-11.

10. Jung SY, Lee MH, Oh TK, Park YH, Yoon JH. Psychrobacter cibarius sp. nov., isolated from jeotgal, a traditional Korean fermented seafood. Int J Syst Evol Microbiol. - 2005. - 55(Pt 2). - Pp. 577-582.

11. Osimani A., Ferrocino I., Agnolucci M., Cocolin L., Giovannetti M., Cristani C., Palla M., Milanovic V., Roncolini A., Sabbatini R., Garofalo C., Clementi F., Cardinali F., Petruzzelli A., Gabucci C., Tonucci F., Aquilanti L. Unveiling hákarl: A study of the microbiota of the traditional Icelandic fermented fish. // Food Microbiology. - 2019. - V. 82. - Pp. 560-572.

12. Pham T.-P.-T., Cadoret F., Tidjani Alou M., Brah S., Ali Diallo B., Diallo A., Sokhna C., Delerce J., Fournier P.-E., Million M., Raoult D. “Urmitella timonensis” gen.nov., sp.nov., “Blautia marasmi” sp.nov., “Lachnoclostridium pacaense” sp.nov., “Bacillus marasmi” sp.nov. and “Anaerotruncus rubiinfantis” sp.nov., isolated from stool samples of undernourished African children. // New Microbes and New Infections. - 2017. - 17. - Pp. 84-88.

13. Seppola M., Olsen R.E., Sandaker E., Kanapathippillai P., Holzapfel W., Ringø E. Random amplification of polymorphic DNA (RAPD) typing of carnobacteria isolated from hindgut chamber and large intestine of Atlantic cod (Gadus morhua l) Syst Appl Microbiol. - 2005. - 29. - Pp. 131-137.

14. Skåra T., Axelsson L., Stefansson G., Ekstrand B., Hagen H. Fermented and ripened fish products in the northern European countries. // Journal of Ethnic Foods. - 2015. - V. 2(1). - Pp. 18-24.

15. Speranza B., Racioppo A., Bevilacqua A., Beneduce L., Sinigaglia M., Corbo M.R. Selection of autochthonous strains as starter cultures for fermented fish products. // Journal of Food Science. - 2015. - V. 80(1). - Pp. 151-160.

16. Vela A.I., Collins M.D., Latre M.V., Mateos A., Moreno M.A., Hutson R., Domínguez L., Fernández-Garayzábal J.F. Psychrobacter pulmonis sp. nov., isolated from the lungs of lambs. Int J Syst Evol Microbiol, 2003. - 53(Pt 2). - Pp. 415-419.

17. Wang Y.-N., Cai H., Chi C.-Q., Lu A.-H., Lin X.-G., Jiang Z.-F., Wu X.-L. Halomonas shengliensis sp. nov., a moderately halophilic, denitrifying, crude-oil-utilizing bacterium. Int. J. Syst. Evol. Microbiol, 2007. - V. 57. - Pp. 1222-1226.

18. Zagorec M., Champomier-Vergès M.C. 2017. Lactobacillus sakei: a starter for sausage fermentation, a protective culture for meat products. Microorganisms. V. 5(3). P. 56.

Войти или Создать
* Забыли пароль?